Sekretariati i Integrimit Evropian (Sekretariati) përbëhet nga nëpunës diplomatikë dhe civilë të ministrisë përgjegjëse për çështjet e integrimit evropian dhe punët e jashtme. Sekretariati është përgjegjës për koordinimin e politikave kombëtare me ato të Bashkimit Evropian.
Sekretariati i Integrimit Evropian, përveç detyrave funksionale në ministrinë përgjegjëse për punët e jashtme, ushtron këto funksione: